MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae HS11286 plasmid pKPHS1

Total Repeats: 326

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016838	TTG	2	6	17	22	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016838	AAT	2	6	106	111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016838	CGC	2	6	158	163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_016838	TGC	2	6	1643	1648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_016838	TTC	2	6	2962	2967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016838	CCA	2	6	2977	2982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_016838	GTT	2	6	3067	3072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016838	ATA	2	6	3085	3090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016838	TTG	2	6	6497	6502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016838	ATA	3	9	6567	6575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016838	TACT	3	12	6582	6593	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_016838	GAA	2	6	7080	7085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016838	TGG	2	6	7092	7097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016838	CAAA	2	8	7160	7167	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_016838	A	6	6	7165	7170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016838	CCG	2	6	7172	7177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_016838	T	7	7	7504	7510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016838	CTG	2	6	7588	7593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_016838	TCGAC	2	10	7601	7610	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_016838	ATG	2	6	7611	7616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016838	TTA	2	6	7910	7915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016838	T	9	9	7919	7927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016838	GT	3	6	7962	7967	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016838	TTG	2	6	7985	7990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016838	TG	3	6	8046	8051	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016838	AGGGC	2	10	8118	8127	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
27	NC_016838	T	6	6	12107	12112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016838	GAC	2	6	12134	12139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016838	TGG	2	6	12180	12185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016838	AAC	2	6	12253	12258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_016838	TTG	2	6	13518	13523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016838	GGA	2	6	15950	15955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016838	TAC	2	6	16256	16261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016838	TAA	2	6	16278	16283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016838	AAACAA	2	12	16303	16314	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_016838	A	7	7	16317	16323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016838	AAC	2	6	16420	16425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016838	C	6	6	18024	18029	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
39	NC_016838	CTC	2	6	19550	19555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_016838	CCG	2	6	19657	19662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_016838	ATG	2	6	19694	19699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016838	TGGC	2	8	19762	19769	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_016838	TA	3	6	19913	19918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016838	TACC	2	8	19984	19991	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_016838	T	7	7	20015	20021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016838	TCA	2	6	20031	20036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_016838	TTGT	2	8	20056	20063	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016838	GAT	2	6	20225	20230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016838	ATT	2	6	20242	20247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016838	ATGA	2	8	20310	20317	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016838	GT	3	6	20479	20484	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016838	ATT	2	6	20496	20501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016838	TGCC	2	8	20514	20521	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_016838	A	6	6	20584	20589	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016838	A	6	6	22969	22974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016838	TACC	2	8	22985	22992	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_016838	CAA	2	6	23007	23012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_016838	T	6	6	23015	23020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016838	ATA	2	6	23037	23042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016838	T	7	7	23046	23052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016838	TTA	2	6	23055	23060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016838	ACT	2	6	23088	23093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_016838	CTA	2	6	23135	23140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_016838	TTAA	2	8	24754	24761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016838	TTA	2	6	24797	24802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016838	T	8	8	24825	24832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016838	T	6	6	24848	24853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016838	ATT	2	6	24887	24892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016838	A	6	6	24900	24905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016838	AAG	2	6	24922	24927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016838	GCA	2	6	25189	25194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_016838	GAG	2	6	25277	25282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016838	TTCA	2	8	25287	25294	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_016838	ACA	2	6	25346	25351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_016838	GT	3	6	25696	25701	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016838	TAA	2	6	25850	25855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016838	TAT	2	6	25869	25874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016838	GTT	2	6	26004	26009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016838	GTC	2	6	26020	26025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_016838	TGA	2	6	26452	26457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016838	ATTA	2	8	26459	26466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016838	A	6	6	26511	26516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016838	CTTG	2	8	30260	30267	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_016838	AATAA	2	10	30331	30340	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016838	TGATC	2	10	31793	31802	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_016838	CAA	2	6	31831	31836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_016838	CA	3	6	32830	32835	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_016838	ATT	2	6	32843	32848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016838	ACC	2	6	32853	32858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_016838	TAC	2	6	34247	34252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_016838	TAT	2	6	34262	34267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016838	AT	3	6	34274	34279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016838	TTTC	2	8	34321	34328	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_016838	ACTT	2	8	35489	35496	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_016838	TTAGC	2	10	35610	35619	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_016838	C	6	6	35646	35651	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
97	NC_016838	CTT	2	6	35699	35704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_016838	GAT	2	6	35720	35725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016838	TACT	3	12	37958	37969	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_016838	TCC	2	6	38812	38817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_016838	ATT	2	6	38833	38838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016838	ATTC	2	8	38868	38875	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_016838	GAAAA	2	10	38944	38953	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016838	AT	3	6	39002	39007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016838	GTG	2	6	39027	39032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016838	GCTG	2	8	40275	40282	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_016838	GCC	2	6	40286	40291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_016838	AGC	2	6	40294	40299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_016838	TAT	2	6	42930	42935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016838	ACT	2	6	43732	43737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_016838	TACT	3	12	43734	43745	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_016838	GT	3	6	43798	43803	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016838	ATA	2	6	43845	43850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016838	TA	3	6	43865	43870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016838	AAT	2	6	44080	44085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016838	AAC	2	6	44121	44126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_016838	TA	3	6	44196	44201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016838	TTA	2	6	44754	44759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016838	T	7	7	44801	44807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016838	AGT	2	6	44858	44863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016838	TCG	2	6	46192	46197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_016838	AAC	2	6	46203	46208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_016838	TGAAA	2	10	46261	46270	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016838	TCG	2	6	46390	46395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_016838	CG	3	6	46967	46972	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_016838	TCC	2	6	48418	48423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_016838	AATT	2	8	48468	48475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016838	TACA	2	8	48489	48496	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_016838	GCC	2	6	50050	50055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_016838	ATC	2	6	56558	56563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_016838	TGG	2	6	56593	56598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016838	A	6	6	62236	62241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016838	TA	3	6	64380	64385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016838	ATA	3	9	64383	64391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016838	TACT	2	8	64398	64405	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_016838	GCC	2	6	64775	64780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_016838	GGC	2	6	64787	64792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_016838	CCAT	2	8	70047	70054	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_016838	AC	3	6	70865	70870	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_016838	TA	3	6	70880	70885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016838	TG	3	6	72104	72109	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016838	GTC	2	6	72112	72117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_016838	ACG	2	6	72181	72186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_016838	TTGT	2	8	73174	73181	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016838	CTC	2	6	73182	73187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_016838	CCA	2	6	73250	73255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_016838	GA	3	6	73286	73291	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016838	GGGC	2	8	73952	73959	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
149	NC_016838	CCCA	2	8	73966	73973	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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292	NC_016838	AACT	2	8	104839	104846	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
293	NC_016838	T	6	6	105484	105489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_016838	A	6	6	105518	105523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_016838	T	6	6	105560	105565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NC_016838	TC	4	8	106473	106480	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
297	NC_016838	TG	3	6	106489	106494	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
298	NC_016838	AAG	2	6	106549	106554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
299	NC_016838	ACT	2	6	107156	107161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
300	NC_016838	ATA	2	6	110294	110299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
301	NC_016838	AGTA	2	8	110300	110307	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
302	NC_016838	AGA	2	6	110331	110336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
303	NC_016838	A	7	7	110358	110364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
304	NC_016838	TGG	2	6	110365	110370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
305	NC_016838	CCA	2	6	110379	110384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
306	NC_016838	AT	4	8	110454	110461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
307	NC_016838	T	7	7	111372	111378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
308	NC_016838	TAT	2	6	112596	112601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
309	NC_016838	ATT	2	6	112634	112639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
310	NC_016838	A	6	6	115018	115023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
311	NC_016838	TGCG	2	8	116381	116388	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
312	NC_016838	TAAG	2	8	119745	119752	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
313	NC_016838	CTA	2	6	119803	119808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
314	NC_016838	ATG	2	6	119857	119862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
315	NC_016838	GAG	2	6	119873	119878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
316	NC_016838	TGAG	2	8	119886	119893	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
317	NC_016838	AT	3	6	119961	119966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
318	NC_016838	TAG	2	6	120005	120010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
319	NC_016838	ATC	2	6	120103	120108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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321	NC_016838	TGG	2	6	121868	121873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
322	NC_016838	AG	3	6	121924	121929	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
323	NC_016838	GAACA	2	10	121977	121986	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
324	NC_016838	TC	3	6	122055	122060	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
325	NC_016838	AT	3	6	122078	122083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
326	NC_016838	T	6	6	122146	122151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.